# Bioinformatika

### A Wikipédiából, a szabad lexikonból.

A bioinformatika biológiai problémák informatikai vizsgálatával foglalkozó interdiszciplináris tudomány, a biológia és az informatika határterülete.

## [szerkesztés] Szakterületei

Három különösen rohamosan fejlődő szakterülete ismert:

- a szupraindividuális bioinformatika, amely az ökológiai rendszerek szimulációját és az ökológiai információs rendszerek komplex fejlesztését jelenti. Ennek a szakterületnek már ma is rengeteg alkalmazása van a mezőgazdaság-tudományban, járványtanban, valamint a környezet- és természetvédelemben.
- a molekuláris bioinformatika, amely a biológiai információhordozó molekulák (nukleinsavak, fehérjék) szekvenciájának elemzésével foglalkozik. Fontos eszköze volt és a Humán Genom Projektnek, a jövőben pedig új alapokra helyezheti a rendszertani kutatásokat, megteremtve egy egységes Bioszisztematika lehetőségét. Nem elhanyagolható a molekuláris bioinformatika szerepe az új gyógyszerhatóanyagok kutatásában sem.
- a számítástechnikai bioinformatika, biológiai rendszerek és komponenseik műszaki számítástechnikai felhasználásának lehetőségeit vizsgáló bionikai fejlesztési irány. (Ma még inkább proto-tudománynak tekinthető).

## [szerkesztés] Magyarországon

Hazánkban 2006. március 4-én alapították meg a Magyar Bioinformatikai Társaságot.

## [szerkesztés] Ajánlott irodalom

- Barnes, M.R. and Gray, I.C., eds., Bioinformatics for Geneticists, first edition. Wiley, 2003. ISBN 0470843942
- Baxevanis, A.D. and Ouellette, B.F.F., eds., Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins, third edition. Wiley, 2005. ISBN 0471478784
- Claverie, J.M. and C. Notredame, Bioinformatics for Dummies. Wiley, 2003. ISBN 0764516965
- Durbin, R., S. Eddy, A. Krogh and G. Mitchison, Biological sequence analysis. Cambridge University Press, 1998. ISBN 0521629713
- Kohane, et al. Microarrays for an Integrative Genomics. The MIT Press, 2002. ISBN 026211271X
- Michael S. Waterman, Introduction to Computational Biology: Sequences, Maps and Genomes. CRC Press, 1995. ISBN 0412993910
- Mount, David W. Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis Spring Harbor Press, May 2002. ISBN 0879696087
- Pevzner, Pavel A. Computational Molecular Biology: An Algorithmic Approach The MIT Press, 2000. ISBN 0262161974

## [szerkesztés] Külső hivatkozások

#### [szerkesztés] Magyar vonatkozású linkek

- Magyar Bioinformatikai Társaság
- Magyar Agrárinformatikai Szövetség
- BCE Multidiszciplináris Doktori Iskola
- Szupraindividuális Bioinformatikai Publikációk

#### [szerkesztés] Nemzetközi szervezetek és intézmények

- - The International Society for Computational Biology
  - Bioinformatics Organization (Bioinformatics.Org): The Open-Access Institute
  - European Bioinformatics Institute
  - Genetic Information Research Institute
  - Open Bioinformatics Foundation: umbrella non-profit organization supporting certain open-source projects in bioinformatics

#### [szerkesztés] Szoftverek, adatbázisok

- - AMOS: a modular, open-source genome assembler
  - BioSimGrid: a distributed database for biomolecular simulations
  - Bioconductor
  - Diamond STING
  - UPMC Bioinformatics Web Tools
  - BioJava
  - BIOMAP Project: Creating a Unified Global Map of various Macromolecular Biological Structures
  - Biomolecular Interaction Network Database
  - BioPerl
  - BioPHP
  - BioLinux
  - BioPython
  - BioRuby
  - CIPRES Project: The Cyber-Infrastructure for Phylogenetic Research
  - EMBOSS
  - Ensembl
  - GMOD: The Generic Model Organism Database Project
  - HARVESTER: bioinformatic meta search engine for proteins in human, mouse and rat
  - MANATEE: a web-based system for genome annotation and curation
  - Proteome Ontology Project: An effort to build a Protein Ontology Specification, a part of BIOMAP Project
  - Sequerome
  - Seqhound
  - MARBL: Text Indexing & Retrieval from Bioinformatics Libraries GPL open source software package to search Genbank
  - Inverse Document Frequency Weighted Genomic Sequence Retrieval
  - BiDE - The Bioinformatics Desktop Environment - An Open Source project to develop a compact Red Hat Linux-based single CD installation, which provides all the flavours of bioinformatics to your desktop
  - BioCircle BiDE Page
  - eBiotools: A software package that brings most of the Bioinformatics programs to the MacOSX

#### [szerkesztés] Tanfolyamok, képzések

- - A long list of courses world wide.
  - Training courses at the European Bioinformatics Institute.
  - Courses given about Ensembl.

#### [szerkesztés] Folyóiratok

- - PLoS Computational Biology
  - Evolutionary Bioinformatics Online
  - Nature Molecular Systems Biology
  - Bioinformatics journal
  - BMC Bioinformatics journal
  - Cancer Informatics Open Access journal
  - Online Journal of Bioinformatics
  - EMBnet.News Online Journal
  - Applied Ecology and Environmental Research

#### [szerkesztés] Egyéb külső hivatkozások

- - OpenSource Bioinformatics / Computational Systems Biology portal
  - Bioinformatics News
  - Books and articles on Bioinformatics from O'Reilly
  - Genome Canada: Canadian Bioinformatics Help Desk
  - Human Genome Project and Bioinformatics
  - Barry Smith's biomedical ontology site
  - Virtual Institute of Microbial Stress and Survival (VIMSS)

A lap eredeti címe "http://hu.wikipedia.org../../../b/i/o/Bioinformatika.html"

Kategóriák: Biológia | Informatika

##### Views

- Szócikk
- Vitalap
- Aktuális változat

##### Keresés

##### Más nyelveken

- English
- العربية
- Deutsch
- Español
- Esperanto
- Français
- 한국어
- Bahasa Indonesia
- Íslenska
- Italiano
- עברית
- Lëtzebuergesch
- Lietuvių
- Nederlands
- 日本語
- ‪Norsk (bokmål)‬
- Polski
- Português
- Русский
- Simple English
- Српски / Srpski
- Srpskohrvatski / Српскохрватски
- Suomi
- Svenska
- ไทย
- Tiếng Việt
- Türkçe
- 中文