Junk-dna

Fra Wikipedia, den frie encyklopædi

I molekylær biologi er junk-dna eller nonsens-dna en samlet benævnelse for kromosomers eller genomers dna-sekvenser, som ikke ser ud til at have nogen funktion. Op imod 97 % af den menneskelige genom er blevet klassificeret som "junk".

Selvom det meste af junk-dna sekvenser formodes at være evolutionære artefakter, som ikke har noget aktuelt formål, tror nogle at junk-dna fungerer på måder, vi endnu ikke kender betydningen af. [1] Ydermere kan bibeholdelsen af noget junk-dna over millioner af års evolution måske betyde, at de har en livsvigtig funktion. Nogle betragter mærkaten "junk" som en forkert benævnelse, mens andre anser junk-dna som dna gemt væk til mulig fremtidig anvendelse, i stedet for noget, der skal smides ud. Nogle foretrækker benævnelsen ikke-kodende dna, selvom junk-dna ofte indeholder transposoner, der koder for proteiner uden klar værdi for deres vært.

Videnskaben funktionel genomik har udviklet mange accepterede teknikker til at karakterisere proteinkodende gener, RNA-gener og regulerende regioner. I det meste af plantes og dyrs genomer udgør det proteinkodende dna kun en mindre procentdel. I menneskets tilfælde mindre end 2 %. Funktionen af resten bliver undersøgt. Meget af det kan identificeres som repeterende dna-sekvenser uden kendt biologisk funktion for deres vært. Det er dog værdifuldt for genetikere, da de kan anvende det til nedarvningsklassifikation. Men når dette er fratrukket junk-dna, er der stadig store mængder sekvenser, som indtil videre ikke kan klassificeres til andet end "junk".

Et organismes genomstørrelse inkl. junk-dna ser ud til at have lille sammenhæng med organismets kompleksitet: Det er blevet rapporteret, at genomet for den encellede organisme Amoeba dubia mængdemæssigt indeholder mere end 200 gange så meget dna som menneskets genom"[2] [3].

Pindsvinefisken Takifugu rubripes genom indeholder mængdemæssigt kun 1/10 af menneskets genom, men ser ud til at have ligeså mange brugte gener som menneskets. Det meste af forskellen ser ud til at ligge i det der i dag kaldes junk-DNA.[4]

I nyere tid er der i forskellige organsimer blevet fundet vigtige funktioner i dna, der tidligere var klassificeret som junk-dna. [5] [6] [7] [8]

[redigér] Kilder/referencer

  1. 14 June 2007, BBC News: Human genome further unravelled Citat: "...it suggests genes, so called junk DNA and other elements, together weave an intricate control network...He said: "The genome looks like it is far more of a network of RNA transcripts that are all collaborating together. Some go off and make proteins; [and] quite a few, although we know they are there, we really do not have a good understanding of what they do. "This leads to a much more complex picture." The researchers now hope to scale up their efforts to look at the other 99% of the genome..."
  2. Gregory, T.R. and P.D.N. Hebert . (1999). "The modulation of DNA content: proximate causes and ultimate consequences". Genome Research 9: 317-324.
  3. Gregory, T.R. (2005). Animal Genome Size Database. http://www.genomesize.com.
  4. Wahls, W.P., et al. (1990). "Hypervariable minisatellite DNA is a hotspot for homologous recombination in human cells". Cell 60 (1): 95-103. PMID 2295091.
  5. 12 May, 2004, BBC News: 'Junk' throws up precious secret Citat: "..."It is very lucky that entire genomes were mapped, as this work is showing." He added: "I think other bits of 'junk' DNA will turn out not to be junk. I think this is the tip of the iceberg, and that there will be many more similar findings."..."
  6. 2005-07-12, Sciencedaily: Rodent Social Behavior Encoded In Junk DNA Citat: "..."It was considered junk DNA because it didn't seem to have any function," noted Hammock..."
  7. October 2004, Scientific american: The Hidden Genetic Program of Complex Organisms Citat: "...But an overlooked regulatory system based on RNA may hold the keys to development and evolution..."
  8. April 24, 2007, Sciencedaily: 'Junk' DNA Now Looks Like Powerful Regulator, Scientists Find Citat: "...Many of those snippets were located in gene-free chromosomal expanses once described by geneticists as "gene deserts." These sections are, in fact, so clogged with useful DNA bits - including the ones Bejerano and his colleagues describe - that they've been renamed "regulatory jungles."...transposons that duplicate themselves and hop around the genome. "We used to think they were mostly messing things up. Here is a case where they are actually useful," Bejerano said..."Now we've shown that transposons may be a major vehicle for evolutionary novelty," he said...."
organisation