Nukleotidas
Straipsnis iš Vikipedijos, laisvosios enciklopedijos.
(Deoksi)nukleotidai - (deoksi)nukleozidų, kurie sudaryti iš heterociklinės bazės ir cukraus, fosfatai. Iš jų net tik sudaromi biopolimerai DNR ir RNR, bet jie įeina ir į kai kurių kofaktorių (NAD, NADP, KoA, FAD, FMN) sudėtį. Nukleotidai atlieka svarbų vaidmenį ląstelės metabolizme, signalo perdavime.
Turinys |
[taisyti] Nomenklatūra
Nukleotidų pavadinimai sudaromi iš keturių raidžių.
- Pirmoji (mažoji) nurodo ar nukleotidas yra ribonukleotidas, ar deoksiribonukleotidas. Ribonukleotido atveju pirmoji raidė nerašoma, o deoksiribonukleotido atveju rašoma d.
- Antroji (didžioji) raidė nurodo kokia heterociklinė bazė įeina į nukleotido sudėtį:
- G: Guaninas
- A: Adeninas
- T: Timinas paprastai neaptinkamas RNR sudėtyje
- C: Citozinas
- U: Uracilas paprastai neaptinkamas DNR sudėtyje
- Trečioji (didžioji) raidė nurodo kiek fosforo rūgšties liekanų yra nukleotido sudėtyje: viena (M; Mono-), dvi (D; Di-), trys (T; Tri-).
- Ketvirtoji raidė P nurodo, kad sudėtyje yra fosforo rūgšties liekanų.
Pavyzdžiui, deoksi citidin tri fosfatas sutrumpintai žymimas dCTP.
[taisyti] (Deoksi)nukleotidų struktūra
Jei fosforo rūgšties liekana jungiasi prie ribonukleozidų, turime ribonukleotidus, jei prie dezoksiribonukleozidų - dezoksiribonukleotidus. Pirmieji yra RNR monomerai, antrieji - DNR monomerai. Jei fosforo rūgšties liekana jungiasi prie adenozino 5'-hidroksilo grupės, turime adenozin-5'-fosfatą, jei prie uridino 2'-hidroksilo grupės - turime uridin-2'-fosfatą, jei prie dezoksitimidino 3'-hidroksilo grupės - dezoksitimidin-3'-fosfatą.
[taisyti] Nukleotidai
Adenozinmonofosfatas AMP |
Adenozindifosfatas ADP |
Adenozintrifosfatas ATP |
Guanozinmonofosfatas GMP |
Guanozindifosfatas GDP |
Guanozintrifosfatas GTP |
Timidinmonofosfatas TMP |
Timidindifosfatas TDP |
Timidintrifosfatas TTP |
Uridinmonofosfatas UMP |
Uridindifosfatas UDP |
Uridintrifosfatas UTP |
Citidinmonofosfatas CMP |
Citidindifosfatas CDP |
Citidintrifosfatas CTP |
[taisyti] Deoksinukleotidai
[taisyti] Nukleotidų gavimas
Iš nukleotidų sudarytos nukleino rūgštys, tad nukleotidai paprastai gaunami jas hidrolizuojant. Hidrolizuojant RNR šarmais gaunama nukleozid-2'-fosfatų ir nukleozid-3'-fosfatų mišinys. Paveikus DNR arba RNR įvairiais fermentais, susidaro ir nukleozid-5'-fosfatų. Nukleino rūgščių hidrolizės produktai rodo, kas rūgšties liekana nukleotiduose gali jungtis prie nukleozidų 2'-hidroksilo, 3'-hidroksilo arba 5'-hidroksilo grupių:
[taisyti] Nukleotidų funkcijos
Nukleotidai įeina ne tik į nukleino rūgščių, bet ir į nukleotidinių kofermentų
- nikotinamidadenindinukleotido (NAD+),
- jo fosforilinto analogo NADP+,
- flavinadenindinukletido (FAD),
- flavinmononukleotido (FMN),
- konfermento A (KoA) ir kt. sudėtį.
Organizme būna ir laisvų nukleotidų. Nukleotidais vadinami ir nukleozid-5'-difosfatai ir trifosfatai. Šie polifosfatai yra labai svarbūs ląstelės bioenergetikai, ypač adenozin-5'-trifosfatas (ATP). Nukleozid-5'-trifosfatai yra nukleino rūgščių biosintezės substratai. Labai svarbūs yra ir nukleozid-3',5'-ciklofosfatai, ypač adenozin-3',5'-ciklofosfatas, kuris yra daugelio hormonų veikimo tarpininkas.
| Nukleorūgštys |
|---|
| Nukleobazės: Adeninas - Timinas - Uracilas - Guaninas - Citozinas - Purinas - Pirimidinas |
| Nukleozidai: Adenozinas - Uridinas - Guanozinas - Citidinas - Deoksiadenozinas - Timidinas - Deoksiguanozinas - Deoksicitidinas |
| Nukleotidai: AMP - UMP - GMP - CMP - ADP - UDP - GDP - CDP - ATP - UTP - GTP - CTP - cAMP - cGMP |
| Deoksinukleotidai: dAMP - dTMP - dUMP - dGMP - dCMP - dADP - dTDP - dUDP - dGDP - dCDP - dATP - dTTP - dUTP - dGTP - dCTP |
| Nukleorūgštys: DNR - RNR - iRNR - miRNR - rRNR - siRNR - tRNR - mtDNR - Oligonukleotidai |

