Restriktaj enzimoj

El Vikipedio

Biologio > Genetiko > Gen-teĥnologio


Malkovrataj ekde 1973, restriktaj enzimoj kapablas rekoni specife mallongan sinsekvon de 4 ĝis 10 bazparoj kaj distranĉi DNA-n ĉe la rikonita loko. Ili ebligas erigi DNA en reduktitajn fragmentojn aŭ trafe distranĉi DNA ĉe specifa loko.La distranĉebla loko ĉe DNA estas palindronaj sinsekvoj, tio signifas ke inversigante nukleotidoj-sinsekvon, oni havigas la saman nukleotid-ordon. Ekz: ATGTA inverse estas ATGTA ankau.Ju pli longas la sinsekvo, des pli ĝi estas mallofta. Estas facile kompreni ke ATA estas pli ofte renkontebla kombinaĵo ol ATGCGTA.

Enhavo

[redaktu] Netfina tranĉo

 Netfina tranĉo: Restrikta enzimo distranĉas nete la dufadenan DNA-n.
Pligrandigu
Netfina tranĉo: Restrikta enzimo distranĉas nete la dufadenan DNA-n.

Iuj enzimoj distranĉas DNA-lokon meze de ĝi kaj produktas du fragmentojn kies ekstremaĵoj estas netaj. Temas tiam pri netfina tranĉo.

[redaktu] Kunteniĝa tranĉo

 Kunteniĝa tranĉo: Restrikta enzimo distranĉas malnete la dufadenan DNA-n.
Pligrandigu
Kunteniĝa tranĉo: Restrikta enzimo distranĉas malnete la dufadenan DNA-n.

Plej parto de la enzimoj tamen distranĉas malsimetrie: oni parolas tiukaze pri kunteniĝa tranĉo (aŭ malnetfina tranĉo). Ĉiu fragmento havas fadenon pli longan ol la alian. Pluraj centoj el tiuj enzimoj estis karakterizitaj: ili rekonas grandan variecon de tiaj distranĉoj.

[redaktu] Uzado

Restriktaj enzimoj estas uzataj por:
establi tranĉaran mapon de ĉiuj DNA-molekuloj kiujn oni
deziras karakterizi. Tio konsistas el determino de la resktriktejoj-ordo laŭlonge de la konsiderata molekulo, kiuj produktos, post ties « enzima digestado », divers-longajn fragmentojn kies longeco povos esti difinita per elektroforezo.
manipuli DNA ĝenerale. Oni ekzemple povas tranĉi plasmidon antaŭ fremd-DNA-enplasmidigo...







[redaktu] Ekzemploj

Enzimo           Organismo-fonto                   Rekonita sinsekvo       Tranĉejo
EcoRI        Escherichia coli                      5'GAATTC              5'---G     AATTC---3'
                                                   3'CTTAAG              3'---CTTAA     G---5'
BamHI        Bacillus amyloliquefaciens        5'GGATCC              5'---G     GATCC---3'
                                               3'CCTAGG              3'---CCTAG     G---5'
HindIII      Haemophilus influenzae            5'AAGCTT              5'---A     AGCTT---3'
                                               3'TTCGAA              3'---TTCGA     A---5'
MstII        Microcoleus species               5'CCTNAGG
                                               3'GGANTCC        
TaqI         Thermus aquaticus                 5'TCGA                5'---T   CGA---3'
                                               3'AGCT                3'---AGC   T---5'
NotI         Nocardia otitidis                 5'GCGGCCGC
                                               3'CGCCGGCG       
HinfI        Haemophilus influenzae            5'GANTC
                                               3'CTNAG
AluI         Arthrobacter luteus               5'AGCT                5'---AG  CT---3'      
                                               3'TCGA                3'---TC  GA---5'

[redaktu] Eksteraj ligiloj

• http://nist.rcsb.org/pdb/molecules/pdb8_1.html
• http://rebase.neb.com
• http://tools.neb.com/NEBcutter2/index.php
• http://rebase.neb.com/rebase
Pligrandigu
Pligrandigu


Ĉi tie estas aldonaj eksteraj ligiloj por la artikolo. Vi povas helpi al Vikipedio se vi elektos la taŭgajn eksterajn ligilojn kaj metos ilin en la artikolon.


Ĉi tie estas aldonaj bildoj por la artikolo. Vi povas helpi al Vikipedio se vi elektos la taŭgajn bildojn kaj metos ilin en la artikolon.